# Akademik Çalışmalar İçin Veri Hazırlamak
## Rapor İçeriğinin Taranması
### ViraPis üzerinden tarama
### Etiketlenmiş ve Düzenli Güncellenen Excel Dosyaları
## Dijital Görüntüler
### Görüntülerin Seçilmesi
### Görüntülerin Etiketlenmesi
{{< video https://www.youtube.com/embed/IR8TuyCucuk >}}
### İş Listesi Oluşturmak
{{< video https://www.youtube.com/embed/w7xrHrTKfRc >}}
### Arşivlenmiş Vakaları Arşivden Geri Çağırmak
{{< video https://www.youtube.com/embed/o895Kdu02Mk >}}
### Sectra IDS7 Arayüz Dili'ni İngilizce'ye çevirmek
{{< video https://www.youtube.com/embed/BwR_fxH6tWk >}}
### Vaka Listesine Gerekli Sütunları Eklemek
- RequestID
- ExamID
{{< video https://www.youtube.com/embed/vocwkiq-Qe0 >}}
### Vaka Listesini Sectra'dan Excel Olarak Almak
{{< video https://www.youtube.com/embed/GbUZQ0urS4Q >}}
### Batch svs export
{{< video https://www.youtube.com/embed/qI9KRC4X7mQ >}}
### svs dosyalarının anonimleştirilmesi
### svs anonimleştirmeye hazırlık ve Vaka Listesi ile anonimleştirlen listeyi eşleştirecek anahtar oluşturmak
- [Kodlar](./scripts/R/paigeExport.qmd)
{{< video https://www.youtube.com/embed/KlR1ikdgIC4 >}}
### svs dosyalarının anonimleştirilmesi MedicalImageAnonymizer
<https://github.com/eDIMESLab/MedicalImageAnonymizer>
<https://github.com/histopathology/MedicalImageAnonymizer>
{{< video https://www.youtube.com/embed/cA4CfqWyVpM >}}
### svs dosyalarının anonimleştirilmesi svs-deidentifier
{{< video https://www.youtube.com/embed/DxlafzYW-9k >}}
<https://pearcetm.github.io/svs-deidentifier/>
<https://github.com/pearcetm/svs-deidentifier>
<https://github.com/histopathology/svs-deidentifier>
{{< video https://www.youtube.com/embed/cPNR4ojHbFE >}}
### ndpi dosyalarının anonimleştirilmesi
<https://github.com/cornish/anonymize-slide-python3>
<https://github.com/histopathology/anonymize-slide-python3>
### wsi-anon
<https://gitlab.com/empaia/integration/wsi-anon>
```bash
forfiles /P "." /c "cmd /c echo F|.\exe\wsi-anon.exe @FILE -n anonymized_@FNAME"
```
### dosyalarının anonimleştirilmesi pma.start
{{< video https://www.youtube.com/embed/SN6l6R7sdYw >}}
### anonimleştirilen dosyaların listesini oluşturmak
{{< video https://www.youtube.com/embed/h5V7Tq59jrM >}}
### Anonimleştirilen Dosyaları Kopyalamak
{{< video https://www.youtube.com/embed/ftoMn8hj0Lw >}}
### Vaka Listesi ile anonimleştirlen listeyi eşleştirecek anahtar oluşturmak
### Orijinal svs doyalarından metadata elde etmek